انشئ قسم نظم وتقنية المعلومات في عام 1979م بهدف تقديم الخدمات المعلوماتية وربط إدارات وأقسام البرنامج المختلفة بنظام حاسب آلي ، ويعتبر البرنامج من أوائل المستشفيات التي حرصت على وجود هذا القسم وتفعيل دوره ومتابعة كل ما هو جديد في هذا المجال عالمياً.
وعلى مدار هذه السنوات تم تطوير العمل بالقسم حيث أصبحت جميع الأقسام الطبية مرتبطة بالحاسب الآلي ضمن شبكة متطورة لمتابعة ملفات المرضى في الأقسام الداخلية وكذلك العيادات الخارجية ، وبالإمكان الآن متابعة المرضى من خلال رصد نتائجهم المخبرية والإشعاعية والأدوية التي تصرف لهم آلياً بواسطة الحاسب الآلي وإضافتها إلى ملف المريض. وقد وصل عدد أجهزة الحاسب الآلي المتوفرة حالياً بالبرنامج أكثر من 850 جهاز كمبيوتر.
كما تم مؤخراً إنشاء مركزاً للطب الاتصالي التي تقلص بدورها حجم التحاويل الخارجية للمرضى ويمكن من خلاله أخذ المشورة الطبية لبعض الحالات من المستشفيات الأخرى من خلال إرسال نتائج الأشعة والتحاليل المخبرية ، إضافة إلى أنه تم تأسيس شبكة الإنترنت وتوصيلها إلى ما يقرب من عدد (30) جهاز كمبيوتر موزعة جميعها على الأقسام الطبية للإستفادة من مواكبة التطور المعرفي في مختلف المجالات الطبية .
كما يوجد بالبرنامج أنظمة إدارية حديثة ومتكاملة مثل أنظمة شئون الموظفين – المالية – التموين والمستودعات – المشتريات – العلاقات الحكومية – الأمن.
كما تم ربط البرنامج مع مركز المعلومات بالقوات المسلحة من خلال قسم الاتصالات الإدارية وأقسام المالية – وشئون الموظفين – والاستعلامات العامة.