الأقسام
قسم المناقصات
متابعة جميع مناقصات البرنامج وتجهيزها ورفعها إلى الجهات المعنية وكذلك متابعة مشاريع الباب الرابع وتجهيزها ورفعها إلى الجهات المعنية ومراقبة مصروفات المشاريع بالحاسب الآلي .
قسم الاستاذ العام
ومن مهامه المراقبة على جميع مصروفات البرنامج ومتابعة ومراقبة الحسابات البنكية وتقديم التسهيلات لجميع الأقسام من سلف نقدية وكذلك الرقابة التامة على جميع أقسام الإدارة المالية.
قسم الميزانية
ومن مهامه تنفيذ جميع الارتباطات المالية وفق التعليمات المالية وتقديم التقارير على جميع مصروفات بنود الميزانية ومراقبة ميزانية البرنامج للتكاليف التشغيلية والرواتب .
قسم التعويضات
ومن مهامه متابعة جميع طلبات إدارة المشتريات والعقود ورفع جميع المستحقات الجاهزة إلى الإدارة العامة للخدمات الطبية ومراقبة السلف النقدية للموردين والأقسام المعنية ومتابعة جميع حسابات المرضى .
قسم المناقصات
متابعة جميع مناقصات البرنامج وتجهيزها ورفعها إلى الجهات المعنية وكذلك متابعة مشاريع الباب الرابع وتجهيزها ورفعها إلى الجهات المعنية ومراقبة مصروفات المشاريع بالحاسب الآلي .
قسم المراجع الداخلي
ومهمته مراجعة جميع المصروفات قبل رفعها إلى الإدارة العامة للخدمات الطبية وذلك لتفعيل الدور الرقابي حسب الأنظمة واللوائح
الصندوق
ومهمته صرف جميع الشيكات الخاصة بالموظفين الجدد والمغادرين و صرف جميع مستحقات الشركات أو المؤسسات أو الأشخاص أصحاب العقارات المستأجرة و استقبال التامين النقدي ومراقبة الحسابات البنكية .